Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NIFKQ9BYG3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms