Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms