Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms