Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMD3Q96D46 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms