Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT28Q7Z3Y7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms