Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TDRD12Q587J7 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms