Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MSMPQ1L6U9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms