Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EEA1Q15075 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EEA1Q15075 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms