Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GAPVD1Q14C86 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
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