Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms