Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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AP3B2Q13367 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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AP3B2Q13367 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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AP3B2Q13367 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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