Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCGQ13326 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms