Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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