Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LRP1Q07954 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms