Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NHLH2Q02577 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms