Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FDFT1P37268 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms