Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPS1P31327 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPS1P31327 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms