Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP4AP20648 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms