Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB9P17482 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms