Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRAMEF4O60810 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms