Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E9PCH4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E9PCH4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E9PCH4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E9PCH4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms