Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
B4DGG1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
B4DGG1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
B4DGG1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
B4DGG1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
B4DGG1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms