Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD1B0YJ81 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms