Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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HDGFL3Q9Y3E1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HDGFL3Q9Y3E1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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