Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD1Q9UIS9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms