Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms