Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms