Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVK-5Q9HDB9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms