Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms