Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIN28AQ9H9Z2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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LIN28AQ9H9Z2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LIN28AQ9H9Z2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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