Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLRP1Q9C000 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms