Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms