Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCER1Q8TC90 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCER1Q8TC90 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms