Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KDM1BQ8NB78 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms