Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AMER3Q8N944 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms