Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms