Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HCP5Q6MZN7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HCP5Q6MZN7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms