Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A3Q5K4L6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms