Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNF628Q5EBL2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNF628Q5EBL2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms