Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms