Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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