Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CCDC85BQ15834 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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