Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CHRNA2Q15822 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CHRNA2Q15822 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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