Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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