Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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