Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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FOXF2Q12947 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXF2Q12947 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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