Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UFM1P61960 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms