Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IQGAP1P46940 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms