Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPS1P31327 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPS1P31327 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPS1P31327 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms