Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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